一般我們購(gòu)買商品化的primary antibody的時(shí)候,抗體的說(shuō)明書(shū)中都會(huì)給我們一個(gè)推薦的抗體使用濃度。這個(gè)濃度在一定程度上來(lái)說(shuō),是過(guò)飽和的,可以滿足大多數(shù)實(shí)驗(yàn)的染色需求。
但是因?yàn)槭沁^(guò)飽和的濃度,這就帶來(lái)了一定程度的抗體浪費(fèi)。而過(guò)量的抗體,也會(huì)大大提高樣本的自發(fā)熒光。
從另一個(gè)角度來(lái)看,因?yàn)閺S家給出的推薦濃度都是基于一個(gè)特定的樣本濃度和樣本體積,所以在一些特殊的實(shí)驗(yàn)中,比如樣本濃度或樣本體積過(guò)大的實(shí)驗(yàn),推薦的濃度就無(wú)法達(dá)到飽和滴加的要求。在這樣的前提下,推薦實(shí)驗(yàn)用戶針對(duì)自己的實(shí)驗(yàn)要求,zui好可以對(duì)抗體進(jìn)行滴定。節(jié)約成本的同時(shí),也可以讓自己的實(shí)驗(yàn)更加。
滴定的原則:
1. 在進(jìn)行滴定實(shí)驗(yàn)前,應(yīng)該遵守一個(gè)實(shí)驗(yàn)一個(gè)變量的原則。既然滴定實(shí)驗(yàn)要求的是摸索出準(zhǔn)確的抗體工作濃度,那在制作樣本前,也需要對(duì)其他的實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行統(tǒng)一。而這些在滴定實(shí)驗(yàn)中的條件,也應(yīng)該沿用到后續(xù)的正式實(shí)驗(yàn)中去。
2. 需要統(tǒng)一的條件:樣本,樣本數(shù)量/管,樣本體積/管,孵育條件等??偟膩?lái)說(shuō),一個(gè)成功的滴定實(shí)驗(yàn),只應(yīng)該有“抗體的終濃度不同”這一個(gè)實(shí)驗(yàn)中的變量。
3. 滴定的稀釋倍數(shù):一般按照5倍稀釋的標(biāo)準(zhǔn)做5個(gè)梯度的原則做滴定實(shí)驗(yàn)。也可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。起點(diǎn)濃度的選擇則需要按照具體的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行分析。比如,對(duì)于PBMC或者裂解后的全血、脾臟之類的樣本,活細(xì)胞比例高,單管樣本一般以1*10^6為上限。可以從推薦用量開(kāi)始,往下5倍稀釋,做5個(gè)梯度。但是有些原代細(xì)胞,比如涉及腫瘤免疫方面的樣本,活細(xì)胞比例低,免疫細(xì)胞的浸潤(rùn)比例低,所以制備的樣本數(shù)量也會(huì)比較大,這個(gè)時(shí)候,也可以選擇超過(guò)推薦的濃度滴加,然后再進(jìn)行梯度稀釋。
4. 滴定實(shí)驗(yàn)完成后,通過(guò)計(jì)算染色指數(shù)(stain Index)確定zui佳抗體濃度。染色指數(shù)公式如下:
示例:
我們以anti-human CD3抗體舉例:在100ul全血樣本中,我們以該抗體推薦的用量5ul/tube 為高濃度,5倍稀釋,并設(shè)置5個(gè)梯度。高濃度至低濃度分別是5ul/100ul blood,1ul/100ul blood,0.2ul/100ul blood,0.04ul/100ul blood,0.008ul/100ul blood。通過(guò)計(jì)算,染色指數(shù)由高濃度到低分別為98.57,106.29,96.97,12.36,8.58。從染色指數(shù)上看,我們挑選出zui優(yōu)的抗體濃度為1ul/100ul blood。即為推薦用量的1/5。
用第三方軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)疊加可以一目了然。
注意事項(xiàng):
1. 對(duì)于一些陽(yáng)性表達(dá)幾乎100%的細(xì)胞,比如PBMC中的CD45,可以在樣本染色后少量加入未染色的細(xì)胞。
2. 對(duì)于表達(dá)量比較少的稀有細(xì)胞群體,在染色時(shí),可加入該群細(xì)胞的父級(jí)細(xì)胞群的抗體。在設(shè)計(jì)多色實(shí)驗(yàn)的滴定時(shí),zui好可以分批滴定。將表達(dá)量高的抗體先進(jìn)行滴定。確定zui佳濃度后,再滴定表達(dá)量少的抗體,并將已經(jīng)滴定好的抗體一同加入。比如我們?cè)诘味ㄍ庵苎械膄oxp3時(shí),zui好可以加入已經(jīng)確定好濃度的CD4抗體。
3. 對(duì)于消化的組織來(lái)說(shuō),因?yàn)榇嬖诖罅康乃兰?xì)胞,所以在這些樣本的滴定過(guò)程中,要先加入死活染料區(qū)分死活,再確定目標(biāo)抗體的濃度。
4. 是否需要在滴定前blocking?取決于正式實(shí)驗(yàn)。如果正式實(shí)驗(yàn)是封閉的,那么滴定實(shí)驗(yàn)也需要。
5. 遇到不同廠家,不同貨號(hào),不同克隆號(hào)的抗體,需要重新滴定。
6. 滴定完成后,理論上只要cat號(hào)一致,lot號(hào)不一致,不需要重新滴定。但是為了保險(xiǎn)起見(jiàn),每一瓶抗體,特別是不同lot的抗體,zui好留一個(gè)樣本的抗體量,以方便日后的QC或者實(shí)驗(yàn)復(fù)盤。
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